Dictionary of the Fungi (2008) [Το λεξικό των Μυκήτων]

10th Edition / 10η Έκδοση

by

P.M. Kirk

P.F. Cannon

D.W. Minter

and

J.A. Stalpers

Πρόλογος

Αυτό το Λεξικό, που διανύει τώρα το 65ο έτος του, στοχεύει να προσφέρει ένα σημείο εισόδου στο άθροισμα των συσσωρευμένων γνώσεων μας σχετικά με τη συστηματική μυκητολογία για όλους όσους εργάζονται με μύκητες. Καλύπτονται όλοι οι οργανισμοί που παραδοσιακά μελετώνται από μυκητολόγους, συμπεριλαμβανομένων των λειχήνων (lichens), των μανιταριών (mushrooms), της μούχλας λάσπης (slime moulds), των ωομυκήτων (water moulds) και των ζυμών (yeasts).

Καθώς έγιναν διαθέσιμα περισσότερα μοριακά δεδομένα, ήταν δυνατό να επιτευχθεί μεγαλύτερη βεβαιότητα σχετικά με τις υψηλότερου επιπέδου σχέσεις των μυκήτων και να δούμε μερικές αινιγματικές ταξινομήσεις να βρίσκουν επιτέλους ένα σπίτι. Ενώ πολλές από τις τάξεις και τις φυλές που αναγνωρίζονται στην ένατη έκδοση αυτού του Λεξικού διατηρούνται εδώ, γνωρίζουμε ότι είναι πιθανή περαιτέρω σημαντική αλλαγή μεταξύ των μυκήτων sensu stricto, με την πρόταση αρκετών νέων ταξινομήσεων υψηλού επιπέδου στο εγγύς μέλλον. Ομοίως, μπορούμε να αναμένουμε περαιτέρω σημαντικές αλλαγές στα ανάλογα του chromistan και των πρωτόζωων μυκήτων καθώς γίνονται διαθέσιμα δεδομένα αλληλουχίας για περισσότερες ταξινομήσεις. Στόχος μας ήταν να αναγνωρίσουμε τέτοιες αλλαγές διατηρώντας ταυτόχρονα μια λειτουργική και ολοκληρωμένη ιεραρχία για τους χρήστες.

Κατά την προετοιμασία της δέκατης έκδοσης, λοιπόν, οι προσπάθειες μας κατευθύνθηκαν κυρίως στην αναθεώρηση της ταξινόμησης των υψηλότερων βαθμίδων στους μύκητες, βασισμένη σε μεγάλο βαθμό στα αποτελέσματα από το έργο AFfOL (Assembling the Fungal Tree of Life / Συγκεντρώνοντας το Μυκητιασικό Δέντρο της Ζωής) στο οποίο αρκετοί από τους συντάκτες αυτού του Λεξικού είχαν στοιχεία. Οι φυλογενετικές πληροφορίες που αποκτήθηκαν από αναλύσεις αλληλουχιών πολλαπλών γονιδίων, με αποκορύφωμα το 2006-7 με τα αποτελέσματα της πρώτης φάσης του έργου AFfOL, έφεραν επανάσταση στην κατανόηση μας για το πώς θα πρέπει να ταξινομηθεί αυτό το βασίλειο. Οι φυλογενετικές αναλύσεις τείνουν να διεγείρουν την αναγνώριση πολλών επιπέδων της συστηματικής ιεραρχίας, και σε μερική απόκριση σε αυτήν την τάση αναγνωρίζουμε πλέον την κατάταξη του υποφύλου εκτός από τις τάξεις και τις υποκατηγορίες για το Βασίλειο των Μυκήτων.

Ο δεύτερος σημαντικός τομέας ανάπτυξης για την Έκδοση 10 του Λεξικού των Μυκήτων ήταν η ενσωμάτωση των ταξινομικών κατηγοριών σε επίπεδο οικογένειας στο νέο ταξινομικό πλαίσιο, καθώς το έργο AFfOL επικεντρώθηκε μόνο στις τάξεις κατά σειρά και άνω. Όπου είναι δυνατόν, αυτό έχει πραγματοποιηθεί χρησιμοποιώντας μοριακά δεδομένα, αλλά εξακολουθεί να υπάρχει ένας σημαντικός αριθμός οικογενειών μυκήτων για τις οποίες δεν υπάρχουν διαθέσιμες πληροφορίες αλληλουχίας. Περισσότερες πληροφορίες μπορείτε να βρεις στη νέα αδελφική δημοσίευση του Λεξικού, στο “Fungal Families of the World” (CABI, 2007).

Πολλές πρόσφατες φυλογενετικές μελέτες έχουν βασιστεί σε υποθέσεις, σχεδιασμένες να ελέγχουν την ακρίβεια με εξελικτικούς όρους παραδοσιακών ταξινομήσεων που βασίζονται στη μορφολογία. Καθώς οι αναμορφικές ταξινομήσεις έχουν μόλις πρόσφατα αρχίσει να ενσωματώνονται πλήρως σε ολομορφικά συστήματα, υπο-εκπροσωπούνται ουσιαστικά σε μοριακές φυλογενετικές μελέτες. Η έκδοση 9 αυτού του Λεξικού ήταν η πρώτη που κατάργησε τα χωριστά συστήματα ταξινόμησης για τα ανάμορφα και τα τηλεόμορφα, αν και για το συντριπτικό ποσοστό των γενών ήταν δυνατό να αντιστοιχιστούν μόνο σε επίπεδο υποφύλου, δηλαδή στα νηματώδη Ascomycota ή Basidiomycota. Πρόσφατες μελέτες επέτρεψαν την ακριβέστερη τοποθέτηση πολλών άφυλων ταξινομικών κατηγοριών, αλλά σήμερα δεν μπορούμε ακόμα να τοποθετήσουμε τα δύο τρίτα των 3000 περιττών αναμορφών γενών που περιλαμβάνονται στην Έκδοση 10 ακόμη και σε επίπεδο τάξης. Τώρα το βασικό ταξινομικό πλαίσιο έχει καθιερωθεί σε αποδεκτό βαθμό βεβαιότητας, ελπίζουμε ότι η προσοχή θα στραφεί προς την εισαγωγή αυτών των ορφανών ταξινομικών κατηγοριών στη σωστή θέση τους στο μυκητιακό σύστημα.

Το ήδη μεγάλο και ταχέως αυξανόμενο σύνολο στοιχείων από μοριακές μελέτες μας οδήγησε επίσης στη ριζική απόφαση ότι αυτή η έκδοση θα πρέπει να περιλαμβάνει τρία μέρη, ένα Λεξικό των Μύκητων, ένα Λεξικό των Οργανισμών που μοιάζουν με μύκητες chromistan / stramenopile και ένα Λεξικό των Μυκήτων που μοιάζουν με πρωτόζωα. Πολλοί άνθρωποι, που δεν είναι εξοικειωμένοι με τις ταξινομήσεις που είναι πλέον αποδεκτές από τους συστηματιστές εδώ και πολλά χρόνια, εξακολουθούν να θεωρούν τους μύκητες ως “φυτά”. Αλλά στην πραγματικότητα οι μύκητες είναι ένα ανόμοιο σύνολο οργανισμών από τουλάχιστον τρία διαφορετικά βασίλεια, με το ενοποιητικό τους χαρακτηριστικό είναι ότι μελετώνται από μυκητολόγους. Οι μύκητες εξελικτικής προέλευσης, η αδελφή ομάδα του βασιλείου οι μύκητες είναι τα Animalia: Οι μύκητες σχετίζονται πιο στενά με τους ανθρώπους που τους μελετούν παρά με τα πράσινα φυτά με τα οποία είχαν ταξινομηθεί προηγουμένως. Αλλά αυτή η δήλωση κρύβει επίσης το γεγονός ότι οι οργανισμοί που μοιάζουν με μύκητες chromistan, εκ των οποίων το Phytophthora infestans (ο αιτιολογικός παράγοντας της λοίμωξης της πατάτας) είναι ίσως το πιο γνωστό παράδειγμα, δηλαδή πολύ μακρινός συγγενής με τους Μύκητες, αντ’ αυτού είναι περισσότερο σύμμαχοι με τα καφέ φύκια, μεταξύ άλλων, μια σαφής ένδειξη ότι ο μυκηλιακός τρόπος ζωής εξελίχθηκε σε τουλάχιστον δύο διαφορετικές περιπτώσεις. Παραδόξως, ωστόσο, οι οργανισμοί που μοιάζουν με πρωτόζωα μύκητες είναι πιο κοντά στους Μύκητες, ταξινομούμενοι στα Αμοιβόζωα με άλλες πρωτόζωες αμοιβάδες. Οι μύκητες μαζί με τα Animalia και μερικές άλλες ομάδες πρωτοζώων αποτελούν την Οπισθόκωντα και αυτή η ομάδα και τα Amoebozoa αποτελούν το πρώτο μεγάλο κλάδο είναι στη βάση των Ευκαρυωτών. Σε προηγούμενες εκδόσεις, για ιστορικούς λόγους, ορισμένες βιογραφίες και μεγαλύτερες καταχωρήσεις (δηλαδή οι αφηγήσεις σε στυλ δοκιμίου για θέματα που σχετίζονται με μυκητολόγους) φαίνεται ότι γράφτηκαν από την άποψη ενός φυσικού ομιλητή της αγγλικής γλώσσας και ότι αντιμετώπισαν τους μύκητες ως συμπλήρωμα της βοτανικής. Δεδομένου ότι το Λεξικό έχει πλέον πραγματικά διεθνή χαρακτήρα και το θέμα του δεν είναι σαφώς βοτανικό, έχει γίνει κάποια προσπάθεια προσαρμογής αυτών των καταχωρήσεων έτσι ώστε, εκτός από την ενημέρωση, να φαίνονται από μια παγκόσμια και ρητά μυκητολογική οπτική. Ένα αποτέλεσμα αυτού ήταν μια σημαντική αύξηση στον αριθμό των επιφανών αλλά αποθανόντων μυκητολόγων που μνημονεύονται με μια βιογραφία σε αυτές τις σελίδες, ιδίως από την Ινδία, την Ιαπωνία και τη Ρωσία, αλλά και για πρώτη φορά συμπεριλαμβανομένων επιστημόνων με καταγωγή από την Αργεντινή, την Κίνα, την Κούβα, το Πακιστάν, την Πορτογαλία, το Πουέρτο Ρίκο, την Ισπανία και την Ουκρανία. Ένας άλλος ήταν ένας καταιγισμός νέων θεμάτων που καλύπτονται από μεγάλες συμμετοχές, ιδίως καλύπτοντας τις νέες τεχνολογίες που έχουν εισέλθει και τη σταδιακά αναπτυσσόμενη υποδομή της μυκητολογίας ως επιστήμης. Οι περιορισμένοι πόροι σημαίνουν ότι η εργασία ενημέρωσης των λογαριασμών τύπου δοκιμίου ήταν ημιτελής και ατελής, σε λίγες περιπτώσεις στον βαθμό που ήταν απαραίτητο να επισημανθεί η καταχώριση με μια προειδοποιητική σημείωση. Για αυτήν την έκδοση, όλες οι βιογραφίες, οι ορισμοί και άλλες μεγαλύτερες εγγραφές βρίσκονται στο πρώτο μέρος, ακόμη και όταν θα μπορούσαν να ανήκουν καταλληλότερα σε ένα από τα άλλα δύο μέρη. Επίσης, οι πόροι δε μας επέτρεψαν να ενημερώσουμε τα κλειδιά για οικογένειες και αυτά συνεχίζουν να παραλείπονται. Καθώς τα υψηλότερα είδη μυκήτων ορίζονται ολοένα και περισσότερο χρησιμοποιώντας μοριακά και όχι μορφολογικά χαρακτηριστικά, μένει να δούμε εάν τα κλειδιά που βασίζονται στη μορφολογία σε αυτό το επίπεδο της νέας συστηματικής ιεραρχίας μπορούν να γίνουν εφαρμόσιμα.

Το συνολικό ύφος των μεμονωμένων καταχωρήσεων σε αυτό το Λεξικό παραμένει παρόμοιο με αυτό των προηγούμενων εκδόσεων. Οι αναφορές αναφέρονται πλήρως σε όλες τις καταχωρήσεις ταξινομικών ονομάτων. Πολλές βιβλιογραφικές πληροφορίες γίνονται διαθέσιμες στο διαδίκτυο και η δέκατη έκδοση αυτού του Λεξικού αντικατοπτρίζει την αυξανόμενη διαθεσιμότητα πληροφοριών από αυτήν την πηγή. Η CABI παράγει τη Bibliography of Systematic Mycology από το 1943 και η παραγωγή μηχανογραφήθηκε στα τέλη της δεκαετίας του 1980. Αυτή η βάση δεδομένων είναι διαθέσιμη στο διαδίκτυο από τα τέλη του 1999 και οι χρήστες αυτού του Λεξικού θα πρέπει να επισκεφτούν αυτόν τον ιστότοπο (www.indexfungorum.org) για ενημερωμένες βιβλιογραφικές αναφορές σχετικά με τη συστηματική των μυκήτων.

Έχοντας συμμετάσχει στενά στη συλλογή και τις αναθεωρήσεις του σταδίου απόδειξης, γνωρίζουμε πολύ καλά τις ατέλειες και τις βελτιώσεις που θα θέλαμε να είχαμε κάνει. Δεν μπορούμε παρά να επαναλάβουμε το σχόλιο από την ένατη έκδοση ότι η φιλοδοξία μας είναι αυτή η έκδοση να αποδειχθεί τουλάχιστον η ίδια “θαυμάσια ατελής δουλειά που χρειάζονται όλοι”.

Στείλε μας τις διορθώσεις και τα σχόλια σου, ώστε η βάση δεδομένων, και όποιο προϊόν διαδέχεται αυτό το βιβλίο, να είναι λιγότερο ατελές και να έχει ακόμη μεγαλύτερη αξία για τους μυκητολόγους όλων των ειδικοτήτων παγκοσμίως. Η δέκατη έκδοση μπορεί κάλλιστα να είναι η τελευταία έντυπη έκδοση του Ainsworth & Bisby’s Dictionary of the Fungi, σίγουρα θα είναι η τελευταία της οποίας τρεις από τους βασικούς συντάκτες βρίσκονται στο τιμόνι. Διότι, όπως και η δέκατη, στα 65 χρόνια της, η επόμενη έκδοση, αν υπάρχει, θα εκδοθεί μετά την αποχώρηση από την επίσημη, πλήρους απασχόλησης αυτών των συντακτών. Ως εκ τούτου, όπως τόσα πολλά καλά πράγματα, …

P.M. Kirk

P.F. Cannon

D.W. Minter

J.A. Stalpers

CABI Europe – UK, Egham and CBS, Utrecht

Περιεχόμενα

Λεξικό των Μυκήτων

Λεξικό των Αναλόγων Μυκήτων chromistan

Λεξικό των Πρωτόζωων Μυκητιακών αναλόγων

(το βιβλίο σε μορφή αρχείου PDF)